丹参锚蛋白重复序列家族基因的克隆和表达分析

张璇,库里满·恰里甫,武玉翠,王喆之

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陕西师范大学学报(自然科学版) ›› 2013, Vol. 41 ›› Issue (4) : 63-66.
生命科学

丹参锚蛋白重复序列家族基因的克隆和表达分析

  • 张璇,库里满·恰里甫,武玉翠,王喆之
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Cloning and expression analysis of SmARP from Salvia miltiorrhiza

  • ZHANG Xuan, Kuliman Qialifu,WU Yu-cui, WANG Zhe-zhi*
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摘要

用降落PCR的方法获得了丹参锚蛋白重复序列家族基因(SmARP).生物信息学显示,SmARP所编码蛋白的分子质量为19,064 kD,理论等电点为8.4,是一种不稳定而且无信号肽和无跨膜区域的蛋白.该蛋白的二级结构中主要存在α 螺旋( 39.64% )和无规卷曲(42.01%),其三维结构模型中每个锚蛋白重复序列折叠成两个反向平行的α-螺旋,每两个α-螺旋中间形成一个长环.实时荧光定量PCR结果显示,该基因在丹参的根、茎、叶、花中均有表达.

Abstract

An ankyrin repeat family protein gene(SmARP)from Salvia miltiorrhiza was cloned using TD-PCR.Bioinformatics analysis showed that the calculated molecular mass is 19,064 kD, and the theoretical isoelectric point is 8.4. Ankyrin repeat protein in S.miltiorrhiza is an unstable protein without signal peptide and transmembrane segments. Predicted secondary structure of SmARP contain, alpha helix( 39.64% )and random coil (42.01%).The three dimensional structure model of SmARP showed that each repeat folds into two antiparallel α-helices followed by a long loop. The real-time PCR results showed SmARP expresses in roots, stems,leaves and flowers of S.miltiorrhiza.

关键词

丹参 / 锚蛋白重复序列家族基因 / 生物信息学分析

Key words

Salvia miltiorrhiza / ankyrin repeat family protein / bioinformatics

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张璇,库里满·恰里甫,武玉翠,王喆之. 丹参锚蛋白重复序列家族基因的克隆和表达分析. 陕西师范大学学报(自然科学版). 2013, 41(4): 63-66
ZHANG Xuan, Kuliman Qialifu,WU Yu-cui, WANG Zhe-zhi. Cloning and expression analysis of SmARP from Salvia miltiorrhiza. Journal of Shaanxi Normal University(Natural Science Edition). 2013, 41(4): 63-66

参考文献

基金

国家自然科学基金资助项目(31000134); 陕西省科技研究发展攻关计划(2006K16-G15).
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